Infekce dýchacích cest patří mezi nejčastější infekční choroby u člověka a jsou spojeny s významnou nemocností i úmrtností. Nejčastěji se jedná o virus SARS-CoV-2, virus chřipky A (InfA), virus chřipky B (InfB) a respirační syncytiální virus (RSV).

Infekce dýchacích cest znamenají také, vzhledem k nákladům na léčbu a sníženou produktivitu pracujících, ekonomickou zátěž. V případě těžkého průběhu nemoci a nutnosti hospitalizace, zvláště pacientů s rizikových skupin, významně rostou náklady na léčbu a zvyšuje se také podíl závažných vedlejších komplikací. V současné době je dostupná účinná antivirová terapie, její efekt je však závislí na včasném podání, a tedy také na včasném stanovené správné diagnózy. V průběhu probíhajících epidemií má rychlá diagnostika význam také pro monitorování šíření infekce a zajištění adekvátní péče o rizikové pacienty. Přesná a rychlá diagnostika také napomáhá racionálnímu využití antibiotik v léčbě respiračních infekcí. Respirační viry způsobují různý klinický obraz, od běžného nachlazení až po závažné respirační syndromy.

Respirační patogeny mohou vyvolat akutní lokální i systémová onemocnění, přičemž nejzávažnější případy se vyskytují u dětí, starších lidí a jedinců s oslabenou imunitou. Mezi příznaky onemocnění dýchacího traktu patří kašel, výtok z nosu, ucpaný nos, horečka, sípání, dušnost, bolest hlavy a bolesti svalů. Vzhledem k podobnosti onemocnění způsobených mnoha viry a bakteriemi je diagnóza založená pouze na klinických příznacích obtížná. Identifikace možných kauzálních agens poskytuje lékařům údaje, které umožňují stanovit vhodnou léčbu pro daného pacienta a reakci orgánů veřejného zdraví pro zamezení dalšímu šíření nemoci.